Ekibimizin çalışma konuları 3 ana başlık altında özetlenebilir:
Erken embriyoda somatik-eşey öncülü blastomerlerin farklılaşması sürecinde somatik dokulara farklılaşabilmek için gereken epigenetik düzenlemelerden biri embriyodaki maternal RNAların yıkılmasıdır. Ekibimiz yeni nesil sekanslama teknolojisi ve mikroRNA mikrodizin yöntemlerini birleştirerek C.elegans oosit, zigotik genom aktivasyonu öncesi ve sonrası erken embriyonun mikroRNAom profillerini çıkarmıştır. Bu verilerin ışığında erken embriyoda totipotensi ve somatik dokulara farklılaşmadan sorumlu yolakların düzenlenmesi ile ilgili çalışmalarımız devam etmektedir.
LAMM sendromu gibi bir hastalığın (Labirent Apilazisine bağlı doğuştan işitme kaybı, Mikroşi ve Mikrodonti: LAMM; OMIM 610706) mekanizmasını anlamak için de hastalığa yol açan normal ve mutant FGF3 geni ve bağlandığı reseptör olan FGFR2’yi memeli hücre kültüründe ifade ettirerek fonksiyonel çalışmalar gerçekleştirilmektedir.
Yaşlanma farklı organ sistemlerinde sürekli ve dejeneratif değişikliklerin meydana geldiği oldukça komplike bir süreçtir. İnsan ömrünün uzaması ile birlikte obezite, diyabet, ateroskleroz ve kanser gibi hastalıkların insidansında da artış gözlenmekte, dolayısı ile yaşlanma alanındaki çalışmalar bu hastalıkların engellenmesi ile de ilgili olduğu için daha fazla önem taşımaktadır. Yaşlanmada rol oynayan yolakları düzenleyen mikroRNAları tanımlamak üzere C.elegans modeli ve yeni nesil sekanslama teknolojisi ile çalışmalar gerçekleştirilmiş ve ömür uzunluğunu regüle eden mikroRNAlar tanımlanmıştır. Bu veriler ışığında ömür uzunluğunu düzenleyen yeni genetik yolakların tanımlanması çalışmaları devam etmektedir.
Obezite ve tip 2 diyabet gibi metabolik düzensizliklerde yağ dokusu harici dokularda hücre içindeki serbest yağ asidi birikimine karşı konulamadığında ER stresi ve lipotoksik hücre ölümü gerçekleşir. Ekibimiz lipotoksik ER stres sürecinde katlanmamış protein yanıtının düzenlenmesinde rol oynayan olası miRNAları tüm miRNAom çalışması ile tanımlamış ve bunların regüle ettiği yolakları analiz etmektedir.
Kanser terapi ve diagnostiğinde kullanılmak üzere monoklonal antikor üretme çalışmalarımız devam etmektedir. Ayrıca ekibimiz farklı disiplinlerdeki bilim insanları ile ortak çalışmalar gerçekleştirmekte ve yaşlanma, diyabet ve kanser tedavisinde kullanılabilecek ilaç adayı molekülleri hem memeli hücre kültürü hem de C.elegans modelinde taramaktadır. Bu modeller kullanılarak yeni ilaç taşıma sistemlerinin geliştirilmesi ve test edilmesi çalışmaları da devam etmektedir.
Ekip Üyeleri:
Onur BENDER (Doktora öğr)
*******************************************************************************************
Yüksek Lisans ve Doktora öğrencileri alınacaktır.
Grup lideri ile irtibata geçerken CV, not ortalaması ve yabancı dil puan belgelerinizi de iletiniz.
*******************************************************************************************
Derece | Kurum | Yıl |
---|---|---|
Yrd. Doç. Dr. | Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü | 2010– |
Uzman | Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü | 2007-2009 |
Doktora Sonrası Araştırmacı | Harvard Üniversitesi Tıp Fakültesi | 2003-2006 |
Derece | Kurum | Yıl |
---|---|---|
Doktora | Bilkent Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü | 1996-2003 |
Yüksek Lisans | Hacettepe Üniversitesi Moleküler Biyoloji ABD | 1994-1996 |
Lisans | Hacettepe Üniversitesi Biyoloji Bölümü | 1989-1994 |
Yıl | Başlık | Destekleyen Kurum | Görevi | Durum |
---|---|---|---|---|
2016-2018 | Epidermal Büyüme Faktörü Reseptörüne Nötralizan Monoklonal Anti-Egfr Antikoru Geliştirilmesi | TÜBİTAK | Yürütücü | ???? |
2013-2014 | Lipotoksik Endoplazmik Retikulum Stres Sonucu İfadesi Değişen miRNA’ların Tanımlanması Ve Regüle Ettiği Genlerin Analizi | TÜBİTAK | Yürütücü | ✓ |
2011-2012 | C.Elegans Dauer-Spesifik Mikrorna’Ların Regüle Ettiği Genlerin Analizi | TÜBİTAK | Yürütücü | ✓ |
2009-2012 | C.Elegans Oosit ve Embriyolarında Global MikroRNAom Profillerinin Analizi | TÜBİTAK | Yürütücü | ✓ |
2008-2009 | Cgh1’in Erken Embriyogenez Sırasında Maternal Rna Metabolizmasına Etkisi | TÜBİTAK | Yürütücü | ✓ |
2008-2010 | Fibroblast Büyüme Faktörü 3 (FGF3) Geninde Tanımlanan L6P ve S156P Mutasyonlarının Etkilerinin İn Vitro Analizi | TÜBİTAK | Yürütücü | ✓ |
2015-2016 | Erişkin Fare Ovaryumu Kök Hücrelerinin İn Vitro Farklılaşma Potansiyeli | TÜBİTAK | Araştırmacı | ✓ |
2013-2015 | Erişkin Fare Ovaryumunda Olası Germline ve Pluripotent Kök Hücrelerin Moleküler ve Hücresel Yöntemlerle Araştırılması | AÜ BAP | Araştırmacı | ✓ |
2012-2015 | Bazı yeni antitümör etkili heterosiklik bileşiklerin sentezi ve moleküler modellemesi | AÜ BAP | Araştırmacı | ✓ |
2012-2014 | Myelodisplastik Sendrom (Mds) Ve Akut Myeloid Lösemi (Aml) Hastalarının Kemik Iliği Kaynaklı Mezenkimal Kök Hücrelerinin (Mkh) Karakterizasyonu Ile Gen/ Mikro Rna (Mirna) Ifade Profillerinin Sağlıklı Kontroller Ile Karşılaştırmalı Analizi | TÜBİTAK | Danışman | ✓ |
2011-2013 | Beta-Katenin, Nükleer Faktör Kappa B Ve Akirin Proteinlerinin Birliktelikleri Ve Kronik Myeloid Lösemide İmatinib Direncindeki Rolleri | TÜBİTAK | Danışman | ✓ |
2011-2013 | Farklı Görüntüleme Yöntemleri Kullanılarak Yapılan Işınlamalar Sonucunda Oluşan Radyasyon Miktarının Osseointegrasyona Etkisinin Değerlendirilmesi | AÜ BAP | Araştırmacı | ✓ |
2009-2012 | Kalıcı Atriyal Fibrilasyonlu ve Sinüs Ritimli Hastalarda Apoptozis İlişkili Genlerin Karşılaştırmalı Analizleri | TÜBİTAK | Danışman | ✓ |
2008-2010 | Rna İnterferanz (Rnai) Tekniği Ile Peste Des Petits Ruminants Virus (Pprv) Replikasyonunun İnhibe Edilmesi-Model Çalışma | TÜBİTAK | Danışman | ✓ |
Öğrenci | Başlık | Durum |
---|---|---|
Onur BENDER | Nötralizan Monoklonal Anti-Egfr Antikoru Geliştirilmesi | ???? |
Mısra NADİR | Lipotoksik endoplazmik retikulum stres sonucu ifadesi değişen miRNAların tanımlanması | ✓ |
Selen GÜÇLÜ | Caenorhabditis elegans oosit ve embriyolarında global mikroRNAom profillerinin analizi | ✓ |
Nuri ERGEN | Türk halk ilaçlarının Caenorhabditis elegans ömür uzunluğuna etkisinin araştırılması | ✓ |
Murat BAŞARAN | Fibroblast büyüme faktörü (FGF3) geninde tanımlanan L6P ve S156P mutasyonlarının etkilerinin in vitro analizi | ✓ |