ONAT LAB

Biyoteknoloji ve moleküler biyoloji çalışmalarında kullanılan temel yöntemler halihazırda daha önce keşfedilmiş olan metabolitler, lipidler ve proteinlerin analiz edilmesini hedeflemektedir. Oysaki canlılarda, herhangi bir çevresel etmene gösterilen cevap sadece belirli yolaklarda değil, birçok fizyolojik etkisi olabilecek metabolik yolaklar, transkripsiyon ve translasyonu regüle eden birçok hücre içi sinyal yolağı üzerinden de gözlemlenebilmektedir. Günümüzde, binlerce farklı makromoleküldeki ve yolaktaki düzenlemeleri doğru ve hızlı bir şekilde analiz etmek yüksek çözünürlüklü kütle spektrometresi teknolojileri ile mümkün olabilmektedir. Dr. Onat, geçmişteki çalışmalarında, enzimatik bozunmaya duyarlı, kararsız makromoleküllerin keşfedilmesi veya miktarlarının daha doğru ölçülebilmesi için Katı Faz Mikroekstraksiyonu (Solid Phase Microextraction /SPME) yöntemini kullanmış ve bu şekilde elde edilen makromoleküllerin analizini yüksek çözünürlüklü LC-MS cihazları ile tayin etmiş, gelişmiş yazılımlarla farklı yolaklardaki düzenlemelerin keşfedilmesinde rol oynamıştır. Bu yöntem ile okyanus dibindeki hidrotermal bacalarda yaşayan canlılardan soya fasulyesinin köklerine, kanser hücrelerinden faredeki beyin hücrelerine birçok hücre içi yolaktaki değişim gözlemlenebilmiştir.

Günümüzde, Onat lab’ın çalışmaları biyoteknoloji, viroloji ve analitik kimyanın kesiştiği noktada yoluna devam etmektedir. Onat lab’ın günümüzdeki ProteoCoVER isimli projesi COVID-19 viral hastalığına yol açan SARS-CoV-2 virüsünün özellikle akciğer epitel hücrelerinde hangi proteomik yolakları avantajına kullandığına, endoplazmik retikulum stresi (ER stress) ve katlanmamış protein cevabının (UPR) SARS-CoV-2 tarafından nasıl düzenlendiğinin bulunmasında kullanılacak sıvı kromatografi-kütle spectrometresi (LC-MS) ve temel moleküler biyoloji yöntemlerine odaklanmaktadır. Elde edilen bu bilgiler ile hedeflenen ER stresi ve UPR ile ilgili olan yolaklarda rol oynayan proteomun SARS-CoV-2 tarafından nasıl avantaja çevrildiği ve bu avantajın hangi ilaçlarla önüne geçilebileceğini bulmaktır. Bu proje ile elde edilecek sonuçlar ile COVID-19 hastalığının ve gelecekte ortaya çıkacak benzer koronavirüs tipi hastalıkların tedavisinde etkin rol oynaması hedeflenmektedir.

Projeler

Güncel Yayın Listesine Ulaşabileceğiniz Akademik Adresler

ORCID

Web of Science

Researchgate

Google Scholar