2007 yılından bugüne Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü Merkez Laboratuvarı Genombilim Biriminde sürdürmekte olduğumuz araştırma faaliyetlerimiz, TÜBİTAK, Üniversitemiz Bilimsel Araştırma Projeleri Müdürlüğü, Ulusal Bor Enstitüsü, COST ve Uluslararası Atom Enerjisi Kurumu destekleri sürmektedir. Bu kapsamda ekibimiz Dünya Sağlık Örgütü istatistiklerine göre insan sağlığı için en önemli tehditlerden biri olarak nitelenen, multifaktöryel ve multigenik karakterleri ile ön plana çıkan kanser için diagnostik ve prognostik yeni biyobelirteçler tanımlamayı hedefleyen genom ve transkriptom ebadındaki analizleri içeren projeler yürütmektedir. Bu çerçevede popülasyon genombilimi ve kök hücre biyolojisi ekibimizin ilgi ve araştırma sahasına girmektedir.
Translasyonel niteliğe sahip olan araştırmalarımızı, 2008 yılı başından itibaren daha organize bir araştırma stratejisi benimseyerek, değişik araştırma gruplarının biraraya geldiği bir araştırma programı halinde yapılandırdık. Biyoteknoloji Enstitüsü misyonlarına uygun ve paralel nitelikte, patentlenebilir bilgi niteliğine sahip olacak olan yeni diagnostik ve prognostik biyobelirteçlerin tanımlanması, klinik ve temel bilimlerin koordine çalışmasını gerektirmektedir. Bu nedenle araştırma programımız, konu ile ilgili temel ve klinik bilim grupları ile de ekip çalışmalarına girmektedir.
Ekip Üyeleri:
Araştırma Asistanı
Seda Taşır
Doktora Öğrencileri
Berşan Seçil Durel
Haldun Doğan
Sulgun Chariyeva
Osman Yaşar
Akademik Özgeçmiş
| Derece |
Kurum |
Yıl |
| Araştırma Görevlisi |
Bilkent Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü |
1995-2000- |
| Doktora Sonrası Araştırıcı |
Cambridge Üniversitesi Onkoloji Bölümü |
2000-2004- |
| Genombilim Birim Sorumlusu |
Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü |
2005-2006- |
| Yrd. Doç. Dr. |
Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları ABD, Pediatrik Genetik BD |
2006-2007- |
| Doç. Dr. |
Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü |
2007-2013- |
| Prof. |
Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü |
2013– |
Egitim Bilgileri
| Derece |
Kurum |
Yıl |
| Lisans |
Hacettepe Üniversitesi Biyoloji Bölümü |
1989-1993 |
| Yüksek Lisans |
Hacettepe Üniversitesi Biyoteknoloji BD |
1993-1995 |
| Doktora |
Bilkent Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü |
1995-2000 |
Akademik/idari Gorevler
| Derece |
Kurum |
Yıl |
| Müdür Yardımcısı |
Ankara Üniversitesi Biyoteknoloji Enstitüsü |
2012– |
Projeler
| Yıl |
Başlık |
Destekleyen Kurum |
Görevi |
Durum |
| 2008-2011 |
Sporadik kolorektal kanser vakalarında genom ebadında TNP profilinin belirlenmesi İle yeni genetik yatkınlık genlerinin ve kanserin gelişmesinde etken olan genlerin belirlenmesi |
TÜBİTAK |
Yürütücü |
Tamamlandı |
| 2008-2011 |
Kanser ve venöz tromboz: tümor gelişimi İle tromboz İlişkisinde koagülomun genom ebadında İfade profillemesi yolu İle tanımlanması |
Ankara Üniversitesi BAP |
Yürütücü |
Tamamlandı |
|
Akut Myeloid Lösemide Wnt sinyal yola_ındaki genlerin DNA Mikroarray Analizi ile tanımlanması |
Ankara Üniversitesi BAP |
Araştırmacı |
Tamamlandı |
| 2006-2011 |
Farklı etnik popülasyonlarda Diffuse Large B-Cell Non-Hodgkin Lemfomaların tedavisinde FDG-PET ve moleküler gen profillemesinin uygulaması |
IAEA |
Araştırmacı |
Tamamlandı |
| 2009-2010 |
Tıpta kullanılacak yeni biyobelirteçlerin tanımlanmasında Mikrodizin (Microarray) platformunda gerçekleştirilen çalışmalarda elde edilen verinin paralel programlama teknikleriyle hızlı bir şekilde web tabanlı analizi hizmeti. |
Sanayi ve Ticaret Bakanlığı |
Araştırmacı |
Tamamlandı |
| 2009-2012 |
Kalıcı Atriyal Fibrilasyonlu ve Sinüs Ritimli Hastalarda Apoptozis İlişkili Genlerin Karşılaştırmalı Analizleri |
TÜBİTAK |
Araştırmacı |
Tamamlandı |
| 2009-2011 |
Anadolu menseili bir bor bakterisi, Bacillus boroniphilus’un tüm gen diziliminin çıkarılması ve hazırlanacak genomik kütüphanesi üzerinden bor ile ilgili genlerinin araştırılması |
BOREN |
Araştırmacı |
Tamamlandı |
| 2010-2013 |
Sporadik kolorektal kanser vakalarında genom ebadında kopya sayısı değişimlerinin belirlenmesi ile kanser başlangıç ve gelişmesinde etken gen veya gen gruplarının tanımlanması |
TÜBİTAK |
Araştırmacı |
Tamamlandı |
| 2010-2013 |
Myelodisplastik sendrom (MDS) ve akut myeloid löseminin (AML) epigenetik profillerinin belirlenmesi suretiyle MDS ve AML prognozunda yeni moleküler belirteçlerin tanımlanması |
TÜBİTAK COST |
Araştırmacı |
Tamamlandı |
| 2013-2016 |
Türk Popülasyonunda Aile Temelli Genom Boyu Asosiyasyon Çalışması Sonucunda Sporadik Kolorektal Kanser İle İlişkilendirilmiş 75 TNP’nin Geniş Bir Popülasyon Çalışması İle Doğrulanması |
TÜBİTAK COST |
Yürütücü |
Tamamlandı |
| 2019-2021 |
Behçet Sendromu’nda miRNom ve Transkriptom Profillerinin Entegrasyonu |
TÜBİTAK 1001 |
Araştırmacı |
Devam ediyor |
| 2019-2021 |
Kanda dolaşan tümör hücrelerinin kuvars akord çatalı tabanlı immünosensörle tayini |
TÜBİTAK 1001 |
Araştırmacı |
Devam ediyor |
Yönetilen Tezler
| Öğrenci |
Başlık |
Durum |
| Yüksek Lisans Tezleri |
| Hülya Sümer |
Nokta mutasyonlarının saptanmasında yüksek çözünülürlüklü erime tekniğinin verim ve hassasiyetinin değerlendirilmesi |
2008 |
| Haldun Doğan |
Yenidoğan sepsislerine neden olan başlıca 3 bakteri türünün hızlı ve güvenilir tanımlanması amacıyla moleküler metod oluşturulması |
2009 |
| Melike Özbilgin Öztürk |
Türk popülasyonunda difüz büyük B hücreli non-hodgkin lenfoma tedavisinde moleküler gen profillemesi |
2011 |
| Hakiimu Kawalya |
Kolorektal kanserde transkriptomik meta analiz ve yeni biyobelirteçlerin keşfi |
2016 |
| Edibe Ece Abacı |
Sporadik Kolorektal Kanserlerde Epigenomik ve Transkriptomik
Profilin Entegrasyonu |
2020 |
| Sulgun Charyyeva |
Kolorektal Kanserde Aday Prognostik Biyobelirteçlerin Arşiv Materyallerinde
Doğrulanması |
2021 |
| Doktora Tezleri |
| Buket Nebiye Demir |
Plazminojen (PLG) geninin denatüre edici yüksek basınçlı sıvı kromatografi (DHPLC) ile mutasyon analizi ve olası mutasyonlu örneklerin DNA dizi analizi ile değerlendirilmesi |
2011 |
| Dilay Çığlıdağ Düngül |
Sporadik kolorektal kanser vakalarında genom ebadında TNP profilinin belirlenmesi ile yeni genetik yatkınlık genlerinin ve kanserin gelişmesinde etken olan genlerin belirlenmesi |
2011 |
| Nevin Belder |
Kanser vakalarında genom ebadında kopya sayısı değişimlerinin ve transkriptom profilinin belirlenmesi ve kanserin gelişmesinde etken yeni genlerin tanımlanması |
2013 |
| Pelin Fidanoğlu |
Türk popülasyonunda genom ebadında SNP veritabanının oluşturulması ve popülasyon verilerimizin uluslararası HAPMAP projesi ile korelasyonu |
2013 |
| Semih Dalkılıç |
Kanser ve venöz tromboz: Tümör gelişimi ile tromboz ilişkisinde koagülomun tanımlanması |
2014 |
| Hülya Sümer Çelebi |
Myelodisplastik sendrom (MDS) ve akut myeloid löseminin (AML) epigenetik profillerinin belirlenmesi suretiyle MDS ve AML prognozunda moleküler belirteçlerin tanımlanması |
2014 |
| Dilara Fatma Akın |
Pediatrik öncü B-ALL’de aday prognostik biyobelirteç genlerinin araştırılması |
2016 |
| Özge Cumaoğulları |
Sporadik kolorektal kanser ile ilişkilendirilmiş aday genlerin incelenmesi |
2017 |
| Haldun Doğan |
Türk Popülasyonunda LDLR, APOB ve PCSK9 Gen Mutasyonu Saptanmayan Fam Lyal H Perkoleserolem Olgularında Fam Lyal H Perkolesrerolem LE LG SB LD RLM Altı Gen Mutasyon Profilinin Ortaya Çıkarılması |
Devam ediyor |
| Berşan Seçil Durel |
Kolorektal Kansere Yönelik Aday Biyobelirteçlerin Validasyonu ve
Bu Biyobelirteçlere Ait Kompetitif Endojen RNA Etkileşim Ağının
(ceRNET) Tanımlanması
|
Devam ediyor |
